ЦКП Высокопроизводительные вычисления

Центр высокопроизводительных вычислений функционирует в ЮГИНФО ЮФУ с 1997 года. В настоящее время он используется сотрудниками ЮГИНФО, мехмата, химфака и физфака ЮФУ, а также учеными Южного научного центра РАН, Уральского государственного университета им. А. М. Горького, Физико-технического факультета Тверского государственного университета и Института Нильса Бора (Дания).

Основу вычислительных ресурсов составляют четыре Linux-кластера, обслуживаемые единой диспетчерской системой управления заданиями OpenPBS. Данная система позволяет одновременно обрабатывать как обычные однопроцессорные программы, выделяя для каждой из них отдельный вычислительный узел, так и объединять мощности нескольких процессоров одной архитектуры для решения одной задачи.

  • IBM Cluster 1350 — Linux-кластер, состоящий из 13 вычислительных узлов, соединенных служебной сетью Gigabit Ethernet и скоростной коммуникационной сетью DDR Infiniband (скорость передачи данных около 1400 Мб/сек, латентность 3.1 мксек). Каждый вычислительный узел представляет собой компьютер с одним 2-х ядерных процессором Intel Xeon 5160 c тактовой частотой 3.0 Ггц и оперативной памятью 8Гбайт. Производительность каждого вычислительного узла на тесте Linpack составляет 21 Gflops, а всего кластера в целом 252 Gflops. Среда параллельного программирования — MPI (MVAPICH-1.1.0). Компилиция и отладка программ выполняется на управляющем компьютере rsufs. Запуск программ в пакетном режиме через систему PBS выполняется командой:

    qsub -q IBMX script

    или

    qsub script, если опция -q внесена в скрипт.
  • INFINI — Linux-кластер, состоящий из 20 вычислительных узлов, соединенных служебной сетью Gigabit Ethernet и скоростной коммуникационной сетью SDR Infiniband (скорость передачи 700 Мб/сек, латентность 5 мксек). Каждый вычислительный узел представляет собой компьютер с процессором Intel Pentium 4 3.4 Ггц и оперативной памятью DDR2 2Гб. Производительность каждого вычислительного узла на тесте Linpack составляет 5.8 Gflops, а всего кластера в целом 115 Gflops. Среда параллельного программирования — MPI (MVAPICH-1.1.0). Компилиция и отладка программ выполняется на хост-компьютере кластера rsuib. Запуск программ в пакетном режиме через систему PBS выполняется командой:

    qsub -q INFINI script
  • Linux-кластер — вычислительная система из 10 узлов, соединенных служебной сетью Fast Ethernet через коммутатор Cisco Catalyst 2900 и скоростной вычислительной сетью Gigabit Ethernet через коммутатор фирмы Allied Telesyn. Каждый из узлов представляет собой компьютер с процессором Pentium 4 2.4 Ггц, 512 Мб оперативной памяти (RAMBUS PC-1066) и 20 Гб жестким диском. Возможно исполнение как однопроцессорных, так и параллельных программ. Среда параллельного программирования — MPI (Mpich-1.2.2). Для компилиции и отладки программ выделен специальный компьютер с такими же характеристиками, как и вычислительные узлы. Постановка задачи в очередь через систему PBS выполняется командой:

    qsub -q LINUX script
  • Кластер WSD - кластер из 8-ми рабочих станций DELL c двухядерными процессорами Intel Core 2 Duo, оперативной памятью 4 Гб и коммуникационной сетью Gigabit Ethernet. Запуск задания командой:

    qsub -q WSD script

Более подробную информацию смотрите здесь.